Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms