Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP100Q494V2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms