Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC153Q494R4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC153Q494R4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms