Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT71Q3SY84 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT71Q3SY84 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms