Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SP6Q3SY56 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SP6Q3SY56 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms