Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRIT3Q3SXY7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRIT3Q3SXY7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRIT3Q3SXY7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms