Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM12Q3MHD2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms