Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms