Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP41Q3LFD5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP41Q3LFD5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms