Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A9Q2M3M2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A9Q2M3M2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms