Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB5Q2M3G0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB5Q2M3G0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB5Q2M3G0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms