Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q1T7F1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Q1T7F1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q1T7F1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q1T7F1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q1T7F1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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