Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC142Q17RM4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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