Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMPG1Q17R60 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IMPG1Q17R60 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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