Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPROQ16827 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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