Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
FOXD1Q16676 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FOXD1Q16676 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FOXD1Q16676 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
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