Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX1AQ16623 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX1AQ16623 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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