Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBBP7Q16576 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP7Q16576 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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