Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLFQ16534 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLFQ16534 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLFQ16534 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLFQ16534 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLFQ16534 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLFQ16534 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLFQ16534 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLFQ16534 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLFQ16534 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLFQ16534 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HLFQ16534 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLFQ16534 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLFQ16534 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLFQ16534 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLFQ16534 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLFQ16534 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HLFQ16534 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLFQ16534 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLFQ16534 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLFQ16534 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLFQ16534 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HLFQ16534 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HLFQ16534 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HLFQ16534 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HLFQ16534 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HLFQ16534 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HLFQ16534 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HLFQ16534 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLFQ16534 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLFQ16534 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLFQ16534 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLFQ16534 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLFQ16534 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLFQ16534 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HLFQ16534 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HLFQ16534 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HLFQ16534 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HLFQ16534 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HLFQ16534 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HLFQ16534 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HLFQ16534 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HLFQ16534 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HLFQ16534 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HLFQ16534 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HLFQ16534 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HLFQ16534 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HLFQ16534 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HLFQ16534 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HLFQ16534 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HLFQ16534 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HLFQ16534 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HLFQ16534 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HLFQ16534 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HLFQ16534 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HLFQ16534 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HLFQ16534 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HLFQ16534 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HLFQ16534 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HLFQ16534 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HLFQ16534 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HLFQ16534 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HLFQ16534 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HLFQ16534 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HLFQ16534 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HLFQ16534 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HLFQ16534 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HLFQ16534 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HLFQ16534 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLFQ16534 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLFQ16534 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLFQ16534 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLFQ16534 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLFQ16534 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLFQ16534 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLFQ16534 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLFQ16534 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLFQ16534 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HLFQ16534 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HLFQ16534 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HLFQ16534 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HLFQ16534 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HLFQ16534 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HLFQ16534 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HLFQ16534 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HLFQ16534 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HLFQ16534 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HLFQ16534 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HLFQ16534 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLFQ16534 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HLFQ16534 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLFQ16534 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLFQ16534 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLFQ16534 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HLFQ16534 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLFQ16534 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLFQ16534 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLFQ16534 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLFQ16534 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HLFQ16534 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms