Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATP6AP1Q15904 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP6AP1Q15904 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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