Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIX1Q15475 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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