Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC23BQ15437 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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SEC23BQ15437 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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SEC23BQ15437 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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SEC23BQ15437 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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SEC23BQ15437 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC23BQ15437 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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