Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SF3A2Q15428 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms