Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B3Q15393 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SF3B3Q15393 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SF3B3Q15393 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SF3B3Q15393 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms