Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT31Q15323 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT31Q15323 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT31Q15323 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms