Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBX2Q14781 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX2Q14781 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms