Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TRIM25Q14258 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TRIM25Q14258 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRIM25Q14258 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRIM25Q14258 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRIM25Q14258 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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TRIM25Q14258 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRIM25Q14258 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TRIM25Q14258 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TRIM25Q14258 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TRIM25Q14258 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TRIM25Q14258 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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