Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE4AQ14139 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE4AQ14139 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms