Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIRBPQ14011 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms