Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6HQ13956 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms