Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX6Q13608 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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