Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF5Q13568 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRF5Q13568 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF5Q13568 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF5Q13568 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF5Q13568 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF5Q13568 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF5Q13568 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms