Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
BFSP2Q13515 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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