Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PICALMQ13492 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms