Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF6Q13247 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF6Q13247 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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