Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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