Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PRDM2Q13029 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PRDM2Q13029 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PRDM2Q13029 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
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