Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN1Q12860 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms