Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 BRE4YDL231C 3378 nt4.74□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 PCL8YPL219W 1479 nt4.74□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 BBC1YJL020C 3474 nt4.74□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 DXO1YDR370C 1329 nt4.73□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 ECM22YLR228C 2445 nt4.73□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 HOS3YPL116W 2094 nt4.73□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 YGL262WYGL262W 528 nt4.73□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt4.73□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 YOL050CYOL050C 321 nt4.73□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 DCS2YOR173W 1062 nt4.73□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 RCM1YNL022C 1473 nt4.73□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 ECM32YER176W 3366 nt4.73□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 STB2YMR053C 2553 nt4.72□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 SSM4YIL030C 3960 nt4.72□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 MAP1YLR244C 1164 nt4.72□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 ASC1YMR116C 960 nt4.72□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 SMA1YPL027W 738 nt4.72□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.72□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 SET4YJL105W 1683 nt4.72□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 YEH2YLR020C 1617 nt4.72□□□□□ -1.65
LSP1Q12230 CEG1YGL130W 1380 nt4.71□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 MCM21YDR318W 1107 nt4.71□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YER134CYER134C 537 nt4.71□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 FRA2YGL220W 363 nt4.71□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 RAD17YOR368W 1206 nt4.71□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 MSK1YNL073W 1731 nt4.71□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YIL028WYIL028W 399 nt4.7□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.7□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YKR104WYKR104W 921 nt4.7□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 ECM15YBL001C 315 nt4.7□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 CCS1YMR038C 750 nt4.7□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.7□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 BIK1YCL029C 1323 nt4.7□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 DBP3YGL078C 1572 nt4.7□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 MTC4YBR255W 2085 nt4.69□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 SMP1YBR182C 1359 nt4.69□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 RMD5YDR255C 1266 nt4.69□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YER076CYER076C 909 nt4.69□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YPL073CYPL073C 486 nt4.69□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 ATG2YNL242W 4779 nt4.69□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 MCP2YLR253W 1710 nt4.69□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 DIP2YLR129W 2832 nt4.68□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 MLH2YLR035C 2088 nt4.68□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 GCV1YDR019C 1203 nt4.68□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 ATP5YDR298C 639 nt4.68□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 CNB1YKL190W 528 nt4.68□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YLR124WYLR124W 345 nt4.68□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 NRK1YNL129W 723 nt4.68□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 snR3snR3 194 nt4.68□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 GSH2YOL049W 1476 nt4.68□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 GLE2YER107C 1098 nt4.67□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 ERG26YGL001C 1050 nt4.67□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 ERV14YGL054C 417 nt4.67□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YGL199CYGL199C 471 nt4.67□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YIL086CYIL086C 309 nt4.67□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.67□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YJL220WYJL220W 453 nt4.67□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 PER33YLR064W 822 nt4.67□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 CKS1YBR135W 453 nt4.67□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 FKH1YIL131C 1455 nt4.67□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 IXR1YKL032C 1794 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 OMS1YDR316W 1416 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 HUL4YJR036C 2679 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 GDH2YDL215C 3279 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 MPC1YGL080W 393 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 NVJ1YHR195W 966 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 PNP1YLR209C 936 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 NMD4YLR363C 657 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YNL143CYNL143C 393 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YNR061CYNR061C 660 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YOL024WYOL024W 519 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YBR016WYBR016W 387 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 DSS4YPR017C 432 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YPR022CYPR022C 3402 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 RSC58YLR033W 1509 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YOL075CYOL075C 3885 nt4.66□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 ALG9YNL219C 1668 nt4.65□□□□□ -1.66
LSP1Q12230 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.65□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 LSM12YHR121W 564 nt4.65□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 OM14YBR230C 405 nt4.65□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 ULS1YOR191W 4860 nt4.65□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 RPB2YOR151C 3675 nt4.65□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 MAL13YGR288W 1422 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 TRE1YPL176C 2352 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 FPK1YNR047W 2682 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YDL241WYDL241W 372 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 BUD25YER014C-A 462 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 ARC1YGL105W 1131 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YGL108CYGL108C 423 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 GRE3YHR104W 984 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 UIP3YAR027W 708 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 NCE102YPR149W 522 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 LYP1YNL268W 1836 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 FOX2YKR009C 2703 nt4.64□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 IDS2YJL146W 1410 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 IFM1YOL023W 2031 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 TRS120YDR407C 3870 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 PDR5YOR153W 4536 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 YDL183CYDL183C 963 nt4.63□□□□□ -1.67
LSP1Q12230 PFA5YDR459C 1125 nt4.63□□□□□ -1.67
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