Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFFO1Q0D2I5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFFO1Q0D2I5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms