Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXM1Q08050 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXM1Q08050 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXM1Q08050 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms