Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFF3Q07654 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms