Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN11Q06124 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN11Q06124 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms