Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms