Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 COS2YBR302C 1140 nt4.15□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.15□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 MET4YNL103W 2019 nt4.15□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 PRP31YGR091W 1485 nt4.15□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YHL012WYHL012W 1482 nt4.15□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YBR139WYBR139W 1527 nt4.15□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 MSK1YNL073W 1731 nt4.15□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 TCM62YBR044C 1719 nt4.15□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 BBC1YJL020C 3474 nt4.15□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 TRE1YPL176C 2352 nt4.14□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 THS1YIL078W 2205 nt4.14□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 RPL15BYMR121C 615 nt4.14□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 NDJ1YOL104C 1059 nt4.14□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 PEP5YMR231W 3090 nt4.14□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 TRM11YOL124C 1302 nt4.14□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 GGA1YDR358W 1674 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 STR2YJR130C 1920 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 KAP114YGL241W 3015 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 ACT1YFL039C 1128 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 RPL24AYGL031C 468 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 BUD13YGL174W 801 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 RAD27YKL113C 1149 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YMR082CYMR082C 357 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YOL024WYOL024W 519 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 PAH1YMR165C 2589 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 RNY1YPL123C 1305 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 CDC15YAR019C 2925 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 TGL1YKL140W 1647 nt4.13□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 MNN1YER001W 2289 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 BOP2YLR267W 1713 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 RPO21YDL140C 5202 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 ARO9YHR137W 1542 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 LAS1YKR063C 1509 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YPK3YBR028C 1578 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 RPC53YDL150W 1269 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 COS7YDL248W 1152 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 COS5YJR161C 1152 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YLR225CYLR225C 1224 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 OPY2YPR075C 1083 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 RGP1YDR137W 1992 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 CUS1YMR240C 1311 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 SEG2YKL105C 3399 nt4.12□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 SNF2YOR290C 5112 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 CWH43YCR017C 2862 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 PTC1YDL006W 846 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YDL241WYDL241W 372 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 RMD5YDR255C 1266 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 PHO92YDR374C 921 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 API2YDR525W 330 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 HPM1YIL110W 1134 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 CUS2YNL286W 858 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 BSD2YBR290W 966 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 KIN2YLR096W 3444 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 VID22YLR373C 2706 nt4.11□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 PHO87YCR037C 2772 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 ARO80YDR421W 2853 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 OCT1YKL134C 2319 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YDR282CYDR282C 1245 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YGR015CYGR015C 987 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 SNL1YIL016W 480 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 EMG1YLR186W 759 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 SUA7YPR086W 1038 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 ABD1YBR236C 1311 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 PRR2YDL214C 2100 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 DIT2YDR402C 1470 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 CDC48YDL126C 2508 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YNR065CYNR065C 3351 nt4.1□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 PRP28YDR243C 1767 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YDL094CYDL094C 510 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 DOS2YDR068W 933 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 NSE3YDR288W 912 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YEL074WYEL074W 339 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YGR269WYGR269W 327 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 MRP4YHL004W 1185 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YJR038CYJR038C 363 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 YBL077WYBL077W 432 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 HRT1YOL133W 366 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 DSS4YPR017C 432 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 VPS69YPR087W 321 nt4.09□□□□□ -1.75
CCE1Q03702 FLC1YPL221W 2382 nt4.09□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 GCV1YDR019C 1203 nt4.08□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt4.08□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt4.08□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt4.08□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt4.08□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt4.08□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 BUD25YER014C-A 462 nt4.08□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 FLO8YER109C 2400 nt4.08□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 YER137C-AYER137C-A 1323 nt4.08□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.08□□□□□ -1.76
CCE1Q03702 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.8 ms