Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ERCC6Q03468 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
ERCC6Q03468 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ERCC6Q03468 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms