Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAX5Q02548 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms