Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC2Q02487 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC2Q02487 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms