Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F1Q01094 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms