Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF9Q00978 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms